南京工程高等职业学校始建于1956年，2002年由江苏省地质矿产厅划归江苏省教育厅管辖，次年，由普通中等职业学校升格为高等职业学校，同时增挂江苏联合职业技术学院南京工程分院，是南京地区唯一一所隶属于江苏省教育厅的公办五年制高等职业学校，国家级重点职业学校，江苏职业教育课程改革实验学校。

学校设有国土资源职业技能鉴定所、中国地质大学远程教育南京学习中心，是国家级建设行业技能型紧缺人才的培养培训基地，东南大学职教师资教育实习基地。
以上信息来源于南京高等职业学校。