为加快发展现代职业教育,构建现代职业教育体系,根据江苏省教育厅《关于公布2015年江苏省现代职教体系建设项目试点的通知》（苏教职[2015]20号）文件精神,2015年盐城生物工程高等职业技术学校和相关普通本科院校联合实施中职与普通本科“3+4”分段培养培养项目。
中职与普通本科“3+4”项目，即学生先在盐城生物工程高等职业技术学校就读3年中职，并考取中级职业资格证书，经相关普通本科院校按转段升学要求考核合格后，参加对口单独招生报名，并参加全省统一组织的考试，进入相关普通本科院校就读4年公办普通本科。
分段培养项目由相关普通本科院校和盐城生物工程高等职业技术学校共同制订人才培养方案，确定转段升学要求，实施分段培养。学生在校学习期间前3年享受国家中职学生减免学费和助学金待遇，后4年享受国家普通高等教育公办本科（本二）学生的各项待遇。学生完成学业，考核合格，分别由盐城生物工程高等职业技术学校颁发普通中专毕业证书，相关普通本科院校颁发公办普通本科毕业证书，符合学位授予条件的授予学士学位。